iOS 9対応は【Cydia Substrate 0.9.6011】時点である程度完了していましたが、更にアップデートが行われ、残っていた不具合が修正されています。
脱獄アプリの親玉…ですので、アップデートをしておきましょう！
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Cydia Substrate 0.9.6101
Saurik氏のリポジトリからリリースされていますので、別途追加などは不要。リポジトリの更新後、アップデートを行ってください。
不具合を修正
【Cydia Substrate 0.9.6100】にてブロック拡張によるクラッシュなどの不具合が修正され、更にCycriptのサポートが行われました。
また、すぐに【Cydia Substrate 0.9.6101】がリリースされ、32ビットデバイスにおけるCycript関連の不具合が修正されています。（こちらが現在の最新版）
再起動は不要
重要なパッケージをアップデート後、よく「再起動」を要求されることがありますが、Cydia Substrateのアップデートでは再起動は不要です。
記事に関係無い投稿で申し訳ありません。更新情報にRocketBootstrapというものが来ているのですが、更新していいのでしょうか？現在のインストール済み一覧にはこの名前は無いのですが？